Evolución del genoma
La causa fundamental del resfriado común es la infección por rinovirus humanos
y la causa fundamental por la que es difícil de combatir es por su gran variabilidad genética (y fenotípica).
Se acaba de publicar la secuencia génica completa de todos los tipos diferentes de rinovirus humanos conocidos (son 99).
Estas secuencias permiten reconstruir el árbol filogenético
de la evolución de estos rinovirus.
¿Para qué puede servir?
Para estudiar la evolución de estos virus pero también para revelar las partes (motivos) que se conservan, potenciales dianas para combatir a estos virus mediante medicinas antivíricas o potenciales vacunas.
Por supuesto, este es un primer paso y todavía queda mucho para ello.
Tiempo al tiempo.
El artículo técnico es Ann C. Palmenberg et al., “Sequencing and Analyses
of All Known Human Rhinovirus Genomes Reveal Structure and Evolution,”
Science 324: 55-59, 3 April 2009 .
La figura muestra las relaciones filogenéticas descubiertas
entre las 99 cepas de rinovirus humanos.
Utiliza la técnica del árbol por consenso entre vecinos para las secuencias
no traducidas de cada gen, llamadas 5'-UTR, la “delantera,” y 3'-UTR,
la “trasera,” donde UTR proviene del UnsTranlated Region.
También se utilizan las posiciones del primer y segundo codón
(secuencia de 3 nucleótidos) de los genes de ARN.
En el diagrama tipo árbol, la longitud de cada rama es proporcional a la similitud entre ellas utilizando como distancia el número de nucleótidos
de diferencia (distancia-p).
Las letras en el anillo más exterior identifican si los rinovirus usan el receptor
ICAM-1 mayor (M) o el receptor LDLR menor (m),
y si su reactividad relativa es similar a la de los grupos “1? y “2?
(tipos de rinovirus clasificados en función de cómo responden
a ciertos antivirales según K. Andries et al.,
“Two groups of rhinoviruses revealed by a panel of antiviral compounds
present sequence divergence and differential pathogenicity,”
Journal of Virology 64: 1117-1123, 1990 ).
(fuente: AAAS)
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